Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO2P25791 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO2P25791 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO2P25791 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO2P25791 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO2P25791 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO2P25791 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO2P25791 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO2P25791 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO2P25791 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO2P25791 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO2P25791 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO2P25791 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO2P25791 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO2P25791 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMO2P25791 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO2P25791 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO2P25791 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO2P25791 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO2P25791 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO2P25791 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO2P25791 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO2P25791 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMO2P25791 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMO2P25791 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMO2P25791 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMO2P25791 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMO2P25791 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMO2P25791 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO2P25791 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO2P25791 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMO2P25791 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO2P25791 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO2P25791 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO2P25791 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO2P25791 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO2P25791 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO2P25791 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO2P25791 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO2P25791 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO2P25791 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO2P25791 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO2P25791 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO2P25791 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO2P25791 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO2P25791 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO2P25791 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO2P25791 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO2P25791 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO2P25791 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO2P25791 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO2P25791 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO2P25791 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO2P25791 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO2P25791 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO2P25791 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO2P25791 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO2P25791 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO2P25791 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO2P25791 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO2P25791 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO2P25791 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMO2P25791 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMO2P25791 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMO2P25791 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMO2P25791 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMO2P25791 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMO2P25791 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO2P25791 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO2P25791 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO2P25791 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO2P25791 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO2P25791 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO2P25791 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO2P25791 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO2P25791 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO2P25791 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO2P25791 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO2P25791 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO2P25791 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO2P25791 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO2P25791 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO2P25791 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO2P25791 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO2P25791 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO2P25791 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO2P25791 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO2P25791 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms