Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMA1P25391 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA1P25391 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA1P25391 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms