Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR2AP24928 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR2AP24928 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms