Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMA2P24043 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA2P24043 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA2P24043 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms