Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRGP23470 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRGP23470 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PTPRGP23470 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
PTPRGP23470 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms