Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA5P20719 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms