Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3AP20336 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3AP20336 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms