Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN2P17706 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN2P17706 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN2P17706 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms