Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL3L1P16619 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCL3L1P16619 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCL3L1P16619 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms