Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF3P15923 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF3P15923 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF3P15923 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF3P15923 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF3P15923 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF3P15923 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF3P15923 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF3P15923 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF3P15923 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF3P15923 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF3P15923 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF3P15923 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF3P15923 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF3P15923 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF3P15923 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF3P15923 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF3P15923 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF3P15923 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF3P15923 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF3P15923 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF3P15923 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF3P15923 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF3P15923 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF3P15923 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF3P15923 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF3P15923 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF3P15923 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF3P15923 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF3P15923 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF3P15923 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF3P15923 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF3P15923 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF3P15923 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF3P15923 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF3P15923 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF3P15923 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF3P15923 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF3P15923 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF3P15923 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF3P15923 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF3P15923 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF3P15923 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF3P15923 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF3P15923 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF3P15923 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF3P15923 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF3P15923 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF3P15923 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF3P15923 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF3P15923 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF3P15923 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF3P15923 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF3P15923 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF3P15923 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF3P15923 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF3P15923 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF3P15923 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF3P15923 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF3P15923 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF3P15923 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF3P15923 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF3P15923 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF3P15923 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF3P15923 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF3P15923 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF3P15923 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF3P15923 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF3P15923 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF3P15923 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF3P15923 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF3P15923 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF3P15923 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF3P15923 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF3P15923 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF3P15923 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms