Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC130P13994 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC130P13994 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC130P13994 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC130P13994 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms