Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH1P12830 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH1P12830 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH1P12830 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH1P12830 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH1P12830 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH1P12830 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH1P12830 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH1P12830 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH1P12830 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH1P12830 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH1P12830 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH1P12830 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH1P12830 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH1P12830 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH1P12830 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH1P12830 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH1P12830 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH1P12830 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH1P12830 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH1P12830 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH1P12830 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH1P12830 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH1P12830 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH1P12830 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH1P12830 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH1P12830 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH1P12830 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH1P12830 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH1P12830 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH1P12830 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH1P12830 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH1P12830 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH1P12830 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH1P12830 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH1P12830 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH1P12830 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH1P12830 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH1P12830 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH1P12830 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH1P12830 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH1P12830 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH1P12830 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH1P12830 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH1P12830 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH1P12830 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH1P12830 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH1P12830 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH1P12830 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH1P12830 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH1P12830 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH1P12830 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH1P12830 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH1P12830 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH1P12830 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH1P12830 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH1P12830 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH1P12830 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH1P12830 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH1P12830 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH1P12830 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH1P12830 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH1P12830 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH1P12830 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH1P12830 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH1P12830 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH1P12830 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH1P12830 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH1P12830 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH1P12830 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH1P12830 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH1P12830 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH1P12830 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH1P12830 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH1P12830 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH1P12830 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH1P12830 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH1P12830 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH1P12830 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH1P12830 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH1P12830 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms