Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT3P12035 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT3P12035 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT3P12035 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT3P12035 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT3P12035 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT3P12035 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT3P12035 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT3P12035 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT3P12035 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT3P12035 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT3P12035 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT3P12035 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT3P12035 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT3P12035 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT3P12035 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT3P12035 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT3P12035 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT3P12035 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT3P12035 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT3P12035 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT3P12035 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT3P12035 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT3P12035 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT3P12035 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT3P12035 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT3P12035 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT3P12035 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT3P12035 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT3P12035 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT3P12035 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT3P12035 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT3P12035 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT3P12035 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT3P12035 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT3P12035 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT3P12035 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT3P12035 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT3P12035 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT3P12035 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT3P12035 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT3P12035 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT3P12035 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT3P12035 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT3P12035 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT3P12035 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT3P12035 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT3P12035 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT3P12035 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT3P12035 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT3P12035 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT3P12035 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT3P12035 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT3P12035 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT3P12035 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT3P12035 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT3P12035 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT3P12035 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT3P12035 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT3P12035 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT3P12035 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT3P12035 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT3P12035 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT3P12035 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT3P12035 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT3P12035 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT3P12035 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT3P12035 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT3P12035 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT3P12035 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT3P12035 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT3P12035 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT3P12035 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT3P12035 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT3P12035 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT3P12035 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT3P12035 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT3P12035 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT3P12035 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT3P12035 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT3P12035 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT3P12035 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms