Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPCP11686 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFTPCP11686 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPCP11686 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPCP11686 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms