Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRSS56P0CW18 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRSS56P0CW18 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRSS56P0CW18 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRSS56P0CW18 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRSS56P0CW18 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRSS56P0CW18 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRSS56P0CW18 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms