Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LDHCP07864 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LDHCP07864 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LDHCP07864 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LDHCP07864 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LDHCP07864 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LDHCP07864 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LDHCP07864 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LDHCP07864 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LDHCP07864 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LDHCP07864 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LDHCP07864 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LDHCP07864 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LDHCP07864 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LDHCP07864 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LDHCP07864 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LDHCP07864 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LDHCP07864 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LDHCP07864 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LDHCP07864 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LDHCP07864 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LDHCP07864 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LDHCP07864 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LDHCP07864 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LDHCP07864 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LDHCP07864 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LDHCP07864 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHCP07864 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHCP07864 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHCP07864 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHCP07864 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHCP07864 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LDHCP07864 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LDHCP07864 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHCP07864 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHCP07864 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHCP07864 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHCP07864 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHCP07864 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHCP07864 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHCP07864 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHCP07864 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHCP07864 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHCP07864 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHCP07864 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHCP07864 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHCP07864 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHCP07864 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHCP07864 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHCP07864 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LDHCP07864 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LDHCP07864 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LDHCP07864 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LDHCP07864 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LDHCP07864 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LDHCP07864 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHCP07864 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHCP07864 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHCP07864 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHCP07864 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHCP07864 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LDHCP07864 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LDHCP07864 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LDHCP07864 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LDHCP07864 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LDHCP07864 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LDHCP07864 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LDHCP07864 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHCP07864 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHCP07864 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHCP07864 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHCP07864 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHCP07864 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHCP07864 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHCP07864 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHCP07864 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHCP07864 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHCP07864 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHCP07864 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHCP07864 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHCP07864 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHCP07864 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHCP07864 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms