Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYL1P05976 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYL1P05976 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYL1P05976 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYL1P05976 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYL1P05976 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYL1P05976 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYL1P05976 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYL1P05976 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYL1P05976 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYL1P05976 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYL1P05976 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYL1P05976 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYL1P05976 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYL1P05976 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL1P05976 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL1P05976 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL1P05976 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL1P05976 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL1P05976 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL1P05976 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL1P05976 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL1P05976 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL1P05976 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL1P05976 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL1P05976 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL1P05976 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL1P05976 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL1P05976 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL1P05976 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL1P05976 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL1P05976 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYL1P05976 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYL1P05976 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYL1P05976 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYL1P05976 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYL1P05976 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYL1P05976 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYL1P05976 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYL1P05976 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYL1P05976 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYL1P05976 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYL1P05976 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYL1P05976 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYL1P05976 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL1P05976 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL1P05976 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL1P05976 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL1P05976 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL1P05976 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL1P05976 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL1P05976 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYL1P05976 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYL1P05976 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MYL1P05976 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYL1P05976 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYL1P05976 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYL1P05976 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYL1P05976 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYL1P05976 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYL1P05976 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYL1P05976 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYL1P05976 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYL1P05976 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYL1P05976 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYL1P05976 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYL1P05976 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYL1P05976 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYL1P05976 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYL1P05976 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYL1P05976 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYL1P05976 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYL1P05976 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYL1P05976 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYL1P05976 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MYL1P05976 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYL1P05976 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYL1P05976 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms