Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL3A1P02461 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL3A1P02461 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
COL3A1P02461 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
COL3A1P02461 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms