Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBC1P01850 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms