Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFP01375 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFP01375 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFP01375 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFP01375 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFP01375 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFP01375 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFP01375 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFP01375 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFP01375 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFP01375 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFP01375 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFP01375 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFP01375 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFP01375 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFP01375 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFP01375 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFP01375 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFP01375 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFP01375 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFP01375 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFP01375 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFP01375 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFP01375 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFP01375 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFP01375 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFP01375 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFP01375 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFP01375 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFP01375 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFP01375 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFP01375 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFP01375 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFP01375 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFP01375 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFP01375 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFP01375 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFP01375 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFP01375 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFP01375 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFP01375 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFP01375 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFP01375 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFP01375 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFP01375 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFP01375 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFP01375 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFP01375 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFP01375 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFP01375 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFP01375 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFP01375 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFP01375 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFP01375 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFP01375 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFP01375 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFP01375 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFP01375 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFP01375 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFP01375 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFP01375 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFP01375 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFP01375 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFP01375 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFP01375 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFP01375 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFP01375 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFP01375 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFP01375 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFP01375 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFP01375 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFP01375 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFP01375 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFP01375 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFP01375 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFP01375 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFP01375 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFP01375 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFP01375 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFP01375 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFP01375 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFP01375 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFP01375 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFP01375 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFP01375 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFP01375 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFP01375 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFP01375 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFP01375 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFP01375 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFP01375 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFP01375 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFP01375 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFP01375 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFP01375 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFP01375 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFP01375 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFP01375 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFP01375 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFP01375 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms