Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NSD2O96028 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NSD2O96028 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NSD2O96028 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NSD2O96028 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NSD2O96028 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NSD2O96028 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NSD2O96028 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NSD2O96028 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD2O96028 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD2O96028 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD2O96028 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD2O96028 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NSD2O96028 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD2O96028 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD2O96028 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD2O96028 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD2O96028 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD2O96028 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD2O96028 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD2O96028 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSD2O96028 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSD2O96028 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD2O96028 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD2O96028 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD2O96028 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD2O96028 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD2O96028 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD2O96028 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSD2O96028 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSD2O96028 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSD2O96028 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSD2O96028 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSD2O96028 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NSD2O96028 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NSD2O96028 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NSD2O96028 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NSD2O96028 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NSD2O96028 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NSD2O96028 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSD2O96028 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSD2O96028 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSD2O96028 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSD2O96028 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSD2O96028 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSD2O96028 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD2O96028 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD2O96028 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD2O96028 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD2O96028 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD2O96028 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD2O96028 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD2O96028 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD2O96028 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD2O96028 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD2O96028 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NSD2O96028 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NSD2O96028 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NSD2O96028 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NSD2O96028 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSD2O96028 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSD2O96028 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSD2O96028 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSD2O96028 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSD2O96028 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSD2O96028 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NSD2O96028 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NSD2O96028 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NSD2O96028 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NSD2O96028 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD2O96028 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD2O96028 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD2O96028 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD2O96028 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD2O96028 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD2O96028 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD2O96028 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD2O96028 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD2O96028 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD2O96028 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD2O96028 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD2O96028 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD2O96028 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD2O96028 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD2O96028 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD2O96028 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD2O96028 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD2O96028 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD2O96028 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSD2O96028 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSD2O96028 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSD2O96028 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD2O96028 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD2O96028 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD2O96028 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD2O96028 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD2O96028 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD2O96028 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD2O96028 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD2O96028 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms