Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTL6AO96019 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6AO96019 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTL6AO96019 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTL6AO96019 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms