Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MATN4O95460 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN4O95460 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN4O95460 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN4O95460 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN4O95460 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN4O95460 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN4O95460 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN4O95460 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN4O95460 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN4O95460 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN4O95460 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN4O95460 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN4O95460 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN4O95460 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN4O95460 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN4O95460 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN4O95460 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN4O95460 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN4O95460 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN4O95460 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN4O95460 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN4O95460 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN4O95460 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN4O95460 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN4O95460 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MATN4O95460 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MATN4O95460 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MATN4O95460 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MATN4O95460 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN4O95460 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN4O95460 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN4O95460 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN4O95460 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MATN4O95460 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN4O95460 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN4O95460 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN4O95460 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MATN4O95460 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MATN4O95460 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MATN4O95460 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MATN4O95460 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MATN4O95460 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MATN4O95460 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MATN4O95460 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MATN4O95460 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MATN4O95460 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MATN4O95460 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MATN4O95460 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MATN4O95460 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MATN4O95460 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MATN4O95460 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MATN4O95460 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MATN4O95460 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN4O95460 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN4O95460 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN4O95460 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN4O95460 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN4O95460 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN4O95460 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN4O95460 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MATN4O95460 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN4O95460 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN4O95460 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN4O95460 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN4O95460 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN4O95460 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MATN4O95460 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN4O95460 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN4O95460 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN4O95460 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN4O95460 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN4O95460 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN4O95460 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN4O95460 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MATN4O95460 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN4O95460 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN4O95460 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN4O95460 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN4O95460 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MATN4O95460 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN4O95460 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN4O95460 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MATN4O95460 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms