Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCELO95171 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCELO95171 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCELO95171 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCELO95171 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCELO95171 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCELO95171 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCELO95171 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCELO95171 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCELO95171 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCELO95171 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCELO95171 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCELO95171 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCELO95171 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCELO95171 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCELO95171 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCELO95171 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCELO95171 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCELO95171 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCELO95171 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCELO95171 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCELO95171 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCELO95171 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCELO95171 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCELO95171 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCELO95171 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCELO95171 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCELO95171 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCELO95171 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCELO95171 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCELO95171 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCELO95171 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCELO95171 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCELO95171 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCELO95171 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCELO95171 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCELO95171 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCELO95171 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCELO95171 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCELO95171 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCELO95171 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCELO95171 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCELO95171 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCELO95171 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCELO95171 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCELO95171 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCELO95171 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCELO95171 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCELO95171 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCELO95171 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCELO95171 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCELO95171 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCELO95171 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCELO95171 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCELO95171 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCELO95171 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCELO95171 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCELO95171 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCELO95171 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCELO95171 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCELO95171 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCELO95171 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCELO95171 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCELO95171 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCELO95171 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCELO95171 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCELO95171 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCELO95171 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCELO95171 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCELO95171 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCELO95171 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCELO95171 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCELO95171 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCELO95171 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCELO95171 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCELO95171 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCELO95171 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCELO95171 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCELO95171 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCELO95171 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCELO95171 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCELO95171 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCELO95171 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCELO95171 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCELO95171 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCELO95171 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCELO95171 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCELO95171 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCELO95171 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms