Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UFL1O94874 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UFL1O94874 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UFL1O94874 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UFL1O94874 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UFL1O94874 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UFL1O94874 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UFL1O94874 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UFL1O94874 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UFL1O94874 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UFL1O94874 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UFL1O94874 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UFL1O94874 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UFL1O94874 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UFL1O94874 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
UFL1O94874 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UFL1O94874 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UFL1O94874 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UFL1O94874 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UFL1O94874 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UFL1O94874 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UFL1O94874 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30■■■□□ 2.39
UFL1O94874 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
UFL1O94874 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UFL1O94874 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
UFL1O94874 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UFL1O94874 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UFL1O94874 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UFL1O94874 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UFL1O94874 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UFL1O94874 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UFL1O94874 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UFL1O94874 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UFL1O94874 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UFL1O94874 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UFL1O94874 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UFL1O94874 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UFL1O94874 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UFL1O94874 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UFL1O94874 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
UFL1O94874 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
UFL1O94874 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
UFL1O94874 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
UFL1O94874 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UFL1O94874 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UFL1O94874 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UFL1O94874 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UFL1O94874 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
UFL1O94874 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UFL1O94874 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UFL1O94874 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UFL1O94874 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UFL1O94874 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UFL1O94874 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UFL1O94874 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UFL1O94874 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UFL1O94874 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UFL1O94874 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UFL1O94874 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
UFL1O94874 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
UFL1O94874 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UFL1O94874 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UFL1O94874 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UFL1O94874 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UFL1O94874 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UFL1O94874 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
UFL1O94874 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UFL1O94874 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UFL1O94874 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UFL1O94874 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UFL1O94874 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UFL1O94874 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UFL1O94874 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UFL1O94874 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UFL1O94874 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms