Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKD3O94806 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD3O94806 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms