Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRPM2O94759 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRPM2O94759 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRPM2O94759 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRPM2O94759 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms