Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LGR5O75473 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LGR5O75473 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGR5O75473 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGR5O75473 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGR5O75473 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGR5O75473 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGR5O75473 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LGR5O75473 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGR5O75473 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGR5O75473 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGR5O75473 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LGR5O75473 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGR5O75473 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGR5O75473 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGR5O75473 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGR5O75473 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LGR5O75473 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LGR5O75473 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LGR5O75473 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LGR5O75473 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LGR5O75473 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LGR5O75473 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LGR5O75473 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LGR5O75473 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LGR5O75473 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGR5O75473 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGR5O75473 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGR5O75473 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGR5O75473 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGR5O75473 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGR5O75473 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGR5O75473 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGR5O75473 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LGR5O75473 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LGR5O75473 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LGR5O75473 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LGR5O75473 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LGR5O75473 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LGR5O75473 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LGR5O75473 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LGR5O75473 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LGR5O75473 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LGR5O75473 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LGR5O75473 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGR5O75473 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LGR5O75473 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LGR5O75473 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LGR5O75473 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LGR5O75473 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LGR5O75473 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LGR5O75473 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LGR5O75473 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LGR5O75473 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LGR5O75473 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LGR5O75473 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LGR5O75473 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LGR5O75473 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LGR5O75473 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LGR5O75473 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LGR5O75473 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LGR5O75473 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LGR5O75473 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LGR5O75473 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LGR5O75473 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LGR5O75473 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGR5O75473 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LGR5O75473 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LGR5O75473 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LGR5O75473 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LGR5O75473 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LGR5O75473 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LGR5O75473 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LGR5O75473 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LGR5O75473 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LGR5O75473 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LGR5O75473 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LGR5O75473 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LGR5O75473 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGR5O75473 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms