Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNASEH1O60930 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNASEH1O60930 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNASEH1O60930 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms