Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA3O60609 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA3O60609 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA3O60609 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms