Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA2O43921 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA2O43921 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA2O43921 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA2O43921 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA2O43921 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA2O43921 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms