Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDIL3O43854 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDIL3O43854 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDIL3O43854 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EDIL3O43854 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms