Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLX3O43711 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLX3O43711 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLX3O43711 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLX3O43711 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLX3O43711 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLX3O43711 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLX3O43711 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLX3O43711 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLX3O43711 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TLX3O43711 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLX3O43711 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLX3O43711 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLX3O43711 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLX3O43711 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLX3O43711 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLX3O43711 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLX3O43711 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLX3O43711 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLX3O43711 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TLX3O43711 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLX3O43711 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLX3O43711 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLX3O43711 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLX3O43711 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLX3O43711 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLX3O43711 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLX3O43711 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLX3O43711 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLX3O43711 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLX3O43711 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLX3O43711 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLX3O43711 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLX3O43711 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLX3O43711 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLX3O43711 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLX3O43711 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLX3O43711 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLX3O43711 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLX3O43711 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLX3O43711 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLX3O43711 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLX3O43711 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLX3O43711 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLX3O43711 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLX3O43711 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLX3O43711 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLX3O43711 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLX3O43711 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLX3O43711 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLX3O43711 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLX3O43711 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLX3O43711 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLX3O43711 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLX3O43711 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLX3O43711 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLX3O43711 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TLX3O43711 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLX3O43711 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLX3O43711 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLX3O43711 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLX3O43711 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLX3O43711 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLX3O43711 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLX3O43711 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TLX3O43711 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLX3O43711 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLX3O43711 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TLX3O43711 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TLX3O43711 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLX3O43711 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLX3O43711 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLX3O43711 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLX3O43711 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLX3O43711 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TLX3O43711 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLX3O43711 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLX3O43711 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLX3O43711 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLX3O43711 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TLX3O43711 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLX3O43711 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.3 ms