Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN6O43657 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms