Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF208O43345 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF208O43345 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF208O43345 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF208O43345 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF208O43345 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF208O43345 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF208O43345 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF208O43345 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF208O43345 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF208O43345 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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