Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODHO43272 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODHO43272 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODHO43272 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODHO43272 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODHO43272 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRODHO43272 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRODHO43272 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRODHO43272 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRODHO43272 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRODHO43272 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRODHO43272 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRODHO43272 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRODHO43272 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRODHO43272 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRODHO43272 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRODHO43272 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRODHO43272 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRODHO43272 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRODHO43272 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRODHO43272 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRODHO43272 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRODHO43272 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRODHO43272 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRODHO43272 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRODHO43272 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRODHO43272 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRODHO43272 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRODHO43272 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRODHO43272 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRODHO43272 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRODHO43272 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRODHO43272 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRODHO43272 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRODHO43272 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRODHO43272 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRODHO43272 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRODHO43272 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRODHO43272 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRODHO43272 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRODHO43272 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRODHO43272 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRODHO43272 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRODHO43272 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRODHO43272 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRODHO43272 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRODHO43272 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRODHO43272 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRODHO43272 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRODHO43272 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRODHO43272 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRODHO43272 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRODHO43272 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRODHO43272 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRODHO43272 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRODHO43272 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRODHO43272 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRODHO43272 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRODHO43272 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRODHO43272 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRODHO43272 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRODHO43272 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRODHO43272 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRODHO43272 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRODHO43272 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRODHO43272 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRODHO43272 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRODHO43272 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRODHO43272 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRODHO43272 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRODHO43272 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRODHO43272 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRODHO43272 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRODHO43272 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRODHO43272 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRODHO43272 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRODHO43272 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRODHO43272 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRODHO43272 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRODHO43272 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRODHO43272 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRODHO43272 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRODHO43272 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRODHO43272 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRODHO43272 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRODHO43272 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRODHO43272 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRODHO43272 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRODHO43272 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRODHO43272 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRODHO43272 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRODHO43272 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms