Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIAH2O43255 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIAH2O43255 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms