Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACOX3O15254 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACOX3O15254 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACOX3O15254 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms