Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1CO15160 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms