Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBTB39O15060 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBTB39O15060 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZBTB39O15060 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBTB39O15060 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBTB39O15060 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBTB39O15060 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZBTB39O15060 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZBTB39O15060 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBTB39O15060 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBTB39O15060 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBTB39O15060 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms