Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC27A2O14975 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC27A2O14975 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC27A2O14975 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.2 ms