Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3C2AO00443 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3C2AO00443 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PIK3C2AO00443 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3C2AO00443 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms