Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CDO00329 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIK3CDO00329 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms