Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIP1O00291 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIP1O00291 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIP1O00291 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIP1O00291 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIP1O00291 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIP1O00291 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HIP1O00291 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HIP1O00291 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIP1O00291 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIP1O00291 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIP1O00291 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HIP1O00291 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIP1O00291 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIP1O00291 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIP1O00291 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIP1O00291 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIP1O00291 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIP1O00291 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIP1O00291 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIP1O00291 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIP1O00291 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HIP1O00291 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIP1O00291 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIP1O00291 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HIP1O00291 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIP1O00291 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIP1O00291 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIP1O00291 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIP1O00291 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIP1O00291 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIP1O00291 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HIP1O00291 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIP1O00291 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIP1O00291 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIP1O00291 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIP1O00291 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIP1O00291 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HIP1O00291 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIP1O00291 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIP1O00291 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIP1O00291 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIP1O00291 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIP1O00291 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIP1O00291 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIP1O00291 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIP1O00291 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIP1O00291 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIP1O00291 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIP1O00291 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIP1O00291 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIP1O00291 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIP1O00291 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIP1O00291 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIP1O00291 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIP1O00291 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HIP1O00291 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIP1O00291 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIP1O00291 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIP1O00291 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIP1O00291 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIP1O00291 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIP1O00291 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIP1O00291 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIP1O00291 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIP1O00291 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIP1O00291 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIP1O00291 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIP1O00291 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIP1O00291 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIP1O00291 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIP1O00291 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIP1O00291 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIP1O00291 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HIP1O00291 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIP1O00291 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIP1O00291 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIP1O00291 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIP1O00291 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIP1O00291 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIP1O00291 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIP1O00291 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIP1O00291 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIP1O00291 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIP1O00291 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIP1O00291 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIP1O00291 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIP1O00291 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIP1O00291 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIP1O00291 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HIP1O00291 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIP1O00291 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms