Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H3BRM9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H3BRM9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H3BRM9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H3BRM9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H3BRM9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H3BRM9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H3BRM9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H3BRM9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H3BRM9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BRM9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BRM9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BRM9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BRM9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BRM9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BRM9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BRM9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H3BRM9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3BRM9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BRM9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BRM9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BRM9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3BRM9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3BRM9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3BRM9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3BRM9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3BRM9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3BRM9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3BRM9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3BRM9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3BRM9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3BRM9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3BRM9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3BRM9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3BRM9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3BRM9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3BRM9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H3BRM9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3BRM9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3BRM9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3BRM9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3BRM9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3BRM9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3BRM9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3BRM9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H3BRM9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3BRM9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3BRM9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3BRM9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3BRM9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H3BRM9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H3BRM9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H3BRM9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H3BRM9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms