Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms