Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROB1E7EW31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROB1E7EW31 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROB1E7EW31 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms