Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf172C9J069 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf172C9J069 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms