Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A8MUA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A8MUA0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MUA0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MUA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MUA0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MUA0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MUA0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A8MUA0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A8MUA0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A8MUA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A8MUA0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A8MUA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A8MUA0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A8MUA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MUA0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MUA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MUA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MUA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MUA0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MUA0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MUA0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MUA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MUA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A8MUA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A8MUA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A8MUA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A8MUA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A8MUA0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A8MUA0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A8MUA0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MUA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MUA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MUA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A8MUA0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A8MUA0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A8MUA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A8MUA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A8MUA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MUA0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MUA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MUA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MUA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MUA0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MUA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MUA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MUA0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MUA0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MUA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MUA0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MUA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MUA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MUA0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MUA0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MUA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MUA0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MUA0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MUA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MUA0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MUA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MUA0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MUA0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MUA0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MUA0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MUA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MUA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MUA0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms