Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERINC4A6NH21 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERINC4A6NH21 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms